António Mota nasceu em Lisboa em 1971. Iniciou o estudo do órgão clássico com o prof. António Duarte, em 1988, tendo depois frequentado o Conservatório Nacional e o Instituto Gregoriano de Lisboa, neste último já sob a orientação do prof. Antoine Sibertin-Blanc.
Ingressou seguidamente na Escola Superior de Música de Lisboa, onde concluiu, em 2000, o Curso Superior de Órgão (licenciatura), sob a orientação do prof. Antoine Sibertin-Blanc, com média final de curso máxima, que lhe valeu uma bolsa de mérito pelo Instituto Politécnico de Lisboa.
Em termos de formação académica António Mota tem, paralelamente, licenciatura e mestrado em Engenharia Electrotécnica e de Computadores, pelo Instituto Superior Técnico (Universidade Técnica de Lisboa), obtidas em 1995 e 1999, respectivamente, tendo nos últimos anos exercido funções de docência e trabalho de investigação nesta área.
É organista titular da Igreja do Sagrado Coração de Jesus em Lisboa, desde 1989. Colabora também frequentemente na Sé Patriarcal de Lisboa, como organista substituto do prof. Antoine Sibertin-Blanc, assim como na igreja dos Jerónimos.
Na qualidade de concertista, António Mota tem exercido atividade regular, atuando tanto a solo como com coros e orquestras.
O seu repertório abranje compositores da época barroca, romântica e contemporânea, com destaque para J. S. Bach e Olivier Messiaen, tendo também interesse pela música ibérica.
Trabalha atualmente como docente na Escola Superior de Música de Lisboa, onde é assistente do prof. Sibertin-Blanc, lecionando as diversas disciplinas específicas do curso de Órgão (Órgão, Acompanhamento e Improvisação, Leitura de Partituras, Repertório).